大雄相信天空上有云之國，遭到好友們的嘲笑。哆啦A夢用未來的神奇工具和大雄共同打造屬於自己的雲之國，建好之後，好友們被邀請上來，大家度過一段快樂的時光。 漂浮的雲之國停在阿爾卑斯山上，大雄他們解救了一個神祕的男孩，不久後男孩失蹤。正當他們四處尋找的時候，突然真正的雲之國出現在他們面前。小夥伴們受到邀請，見識到了雲之國高度發達的文明，深表驚奇。但是他們卻被天上人軟禁，無法回到地面。更進一步得知，天上人正在密謀一個“諾亞計劃”，企圖用洪水將為非作歹的人類從地球上抹去……